H. Muchsin Rahakbauw sebagai Ketua PWNU Papua Barat dan juga Ketua FKUB Manokwari menolak keras kelompok intoleran FPI di Papua Barat, beliau juga menolak kedatangan Rizieq Shihab karena telah menimbulkan serangkaian kekacauan di Jakarta oleh sebab itu, beliau mengajak seluruh masyarakat terutama kaum muslim terkhusus lagi warga NU untuk menolak keras kedatangannya.
Sebagai ketua PWNU Papua Barat dan FKUB Manokwari beliau juga mengajak seluruh masyarakat muslim untuk menolak segala bentuk kegiatan intoleran di Papua Barat. “Kami di Papua Barat hidup damai dan rukun, maka dari itu saya mengajak agar masyarakat menolak kedatangan Rizieq Shihab yang nantinya akan menimbulkan kekacauan di Papua Barat” tegasnya
